Cette église fait partie de l'Unité Pastorale de Braine l'alleud.

Dès le début du premier millénaire, Lillois fit partie de la seigneurie du chapitre Sainte-Gertrude de Nivelles.

L’église paroissiale est dédiée à Sainte-Gertrude. Le bâtiment actuel, d’aspect moderne, a été béni le 31 mars 1973.

Au début du 13éme siècle, les cisterciennes d’Aywières s’y étaient installées quelques années avant de s’implanter définitivement à Couture-Saint-Germain. La très belle ferme de la Neuve-Cour, dont l’origine remonte au 13éme siècle, fut une de leurs propriétés. Reconstruite dans le dernier quart du 18éme siècle, elle a tous les caractères de la ferme brabançonne.

Un moulin à vent, datant de 1859, cessa ses activités meunières lorsqu’il perdit ses ailes au début du 20éme siècle.